Ce texte révolutionnaire démontre que Newton, figure majeure des grandes mutations scientifiques du XVIIe siècle, tenait en haute estime la philosophie hermétique. Plus encore, il révèle que Newton était à ce point attaché à la pensée des Anciens qu’il y a découvert une confirmation de ses propres découvertes.D’après le mathématicien, principe de gravité et mécanique classique étaient déjà pleinement contenus dans les textes de Lucrèce ou de Démocrite. Le mathématicien fait même remonter l’origine de l’atomisme à la philosophie mystique, enseignée en Egypte et en Phénicie. Pour lui, le mystère des nombres, comme celui des hiéroglyphes, est étroitement lié à la philosophie mystique. C’est dans le mythe et l’alchimie que Newton redécouvre le véritable ordonnancement de la matière.